Los estudiantes de segundo año de secundaria, Haruka Nanase y Makoto Tachibana, se encuentran con Nagisa Hazuki, una estudiante transferida que era miembro del equipo en un club de natación local cuando eran niños. El trío se cuela en su antiguo edificio de la piscina para desenterrar una cápsula del tiempo donde están enterrados, cuando se reúnen con Rin Matsuoka, el cuarto miembro de su antiguo equipo que se fue a estudiar a Australia. Rin es grosero con ellos, inmediatamente desafiando a Haruka a una carrera. Casi se enfrentan hasta descubrir que la piscina está vacía. La noche siguiente, el trío se reúne con la hermana menor de Rin, Gou Matsuoka, quien les informa que Rin está ahora en segundo año en la cercana Academia Samezuka. Ellos visitan el lujoso nanotorium de la academia, ingresando después de las horas para ser descubiertos por Rin, quien los ordena. Haruka luego sale de la piscina y desafía a Rin a una carrera de estilo libre.